20200630

Información General y Condiciones de Servicio

Ubicación
El Laboratorio de Citometría de Flujo, sede CMN SXXI, de la Coordinación de Investigación en Salud del IMSS se encuentra ubicado en la planta baja del Hospital de Especialidades del Centro Médico Nacional Siglo XXI. La entrada más cercana es por la Puerta 2, en Av. Cuauhtémoc 330, Doctores; delegación Cuauhtémoc, C.P. 06720, Ciudad de México, México.


Servicios que ofrece
- Análisis de partículas en suspensión que midan entre 0.5 y 50 µm, de acuerdo a las especificaciones de los  equipos.
-  Identificación y caracterización celular de muestras mediante inmunofenotipo.
-  Separación celular (sorting), desde una y hasta seis vías a partir de una misma muestra y en placa.
-  Lectura de arreglos citométricos de perlas para cuantificación de citocinas solubles.
-  Asesoría técnica: diseño de paneles, protocolos, análisis de datos, etc.

Usuarios
Cualquier usuario que lo solicite, tanto dentro como fuera del IMSS.
  • Importante: El usuario es responsable de la preparación y reactivos de la fase pre-analítica (antes de pasar al citómetro), de acuerdo a la aplicación a utilizar.

Pago de servicios
La información respecto a este tema se discutirá directamente con la administración del Centro de Instrumentos, en el momento que el usuario presente su proyecto.


Procedimiento de trabajo

El usuario titular presentará su proyecto y cuales son las técnicas citométricas que requiere, realizando una cita al correo flowcyt.cmn.sigloxxi@gmail.com

En esta reunión (presencial o virtual) quedará especificado el tipo de servicio que requiere (asesoría, adquisición, separación celular), el equipo más conveniente de acuerdo al protocolo y la lista de insumos necesarios dependiendo del equipo. La selección del Citómetro se hará de entre una de las siguientes opciones:

o  Aurora (Espectral)       o  FACS Aria IIu       o  BDInflux

Podrá encontrar información más detallada sobre los equipos disponibles dando clic aquí

Una vez establecido el plan de trabajo a realizar, el usuario titular llenará la solicitud de servicio que se encuentra en este mismo sitio, donde se especificarán aspectos importantes del proyecto y los datos de contacto.

Para agendar su primera cita de trabajo y para todas las subsecuentes, es necesario verificar en el Calendario de citas correspondiente a su equipo de interés la disponibilidad de horarios y seguir las indicaciones que se encuentran junto con el calendario para que quede apartada su cita. El usuario se compromete a presentarse puntualmente en la fecha y hora acordadas, trayendo consigo sus muestras en las condiciones indicadas en la solicitud, así como el material extra que sea necesario de acuerdo al servicio y que también se encuentra especificado en cada solicitud. 

Los archivos obtenidos una vez adquiridas las muestras serán entregados al usuario al finalizar la cita en un DVD que deberá traer consigo. El Laboratorio no se hace responsable por datos no exportados ni puede asegurar su almacenamiento para fechas posteriores.

Si el usuario no pudiera presentarse a su cita, se le solicita que cancele vía telefónica con el mayor tiempo de anticipación posible, con la finalidad de liberar el espacio para otro usuario que lo requiera y de ser posible re-agendar su cita oportunamente.

Si tiene alguna pregunta específica sobre el servicio que no se encuentre cubierta en la información anterior, no dude en comunicarse al correo flowcyt.cmn.sigloxxi@gmail.com, donde con gusto le atenderemos.

20200629

Calendario de Citas

Para aprovechar al máximo este calendario es importante revisar atentamente la información que se encuentra más adelante y asegurarse de que la página se encuentra actualizada. 


Este calendario es informativo, con el fin de que los usuarios puedan acceder a la programación de las agendas de los equipos desde donde estén y en cualquier momento. Cabe resaltar que no es posible agendar citas en línea, la solicitud de las mismas se realiza vía telefónica. Una vez que identifique el horario libre que desee apartar, favor de comunicarse al teléfono 5627-6900 ext. 21475, donde con gusto le atenderemos. 

El calendario se actualiza en tiempo real en horario de oficina (L-V, 8:00-16:00 hrs); si se llegara a agendar una cita pasado este horario, la información será actualizada el día hábil posterior a primera hora. 

Uso del calendario 

Las citas se muestran de un color diferente para cada equipo: Aurora (Espectral), FACS Aria y BD Influx. Si sólo requiere la agenda de un equipo en específico, es posible desactivar las casillas correspondientes a los demás equipos en el menú desplegable que se encuentra en la esquina superior derecha del calendario (junto a la pestaña "Agenda"), con lo que se puede visualizar con mayor comodidad la información de interés.

Sobre la esquina superior izquierda del calendario se encuentran, de izquierda a derecha: el botón "Hoy", que lleva la agenda al día en curso; flechas de navegación que permiten desplazarse a la siguiente semana/mes; y un menú desplegable donde se indica la semana/mes mostrados y que se puede abrir para buscar a una fecha específica. Sobre la esquina superior derecha se encuentran las pestañas "Semana", "Mes" y "Agenda" con las que se puede cambiar la visualización del calendario según lo indica su nombre, así como el menú desplegable de los equipos mencionado anteriormente. 


Esperamos que esta información les sea de utilidad. Cualquier duda o comentario no duden ponerse en contacto vía telefónica o por correo electrónico

20200628

Formatos de Solicitud de Servicio

La Solicitud de Servicio que se encuentra en el enlace es útil para cualquiera de los servicios: Asesoría, Adquisición y Separación celular (Sorting). 

Es necesario contar con una solicitud por Usuario y por Equipo. Por ejemplo: si requieren servicio de adquisición en el Espectral pero también servicio de sort en el BDInflux, se requieren dos solicitudes a nombre del mismo usuario (una por cada servicio y equipo), aunque los servicios se asocien al mismo protocolo de investigación. 

Para mantener actualizada la base de datos del laboratorio, es muy importante contar con una solicitud por usuario (es decir, cada alumno que use los citómetros para sus respectivos proyectos). En el mismo sentido, será necesario renovar las solicitudes al inicio de cada año. 

No es necesario llenar una solicitud por cita. Sólo se requiere que indiquen un estimado del tiempo que harán uso del servicio a largo plazo, como se indica en las respectivas solicitudes. 


A partir del 1° de agosto de 2020 no se brindará servicio a ningún usuario que no cuente con una solicitud previa a su cita.

Solicitud de Servicio: https://forms.gle/aiieDva1szFJPY6r9

20200627

Citómetros disponibles

En el Centro de Instrumentos contamos con cuatro citómetros de flujo a su servicio, de entre los cuales podrá elegir una vez identificadas las necesidades de su experimento. Los equipos disponibles se muestran a continuación. 


BDInflux
Citómetro digital analizador y sorter. 

Capacidad de análisis: 16 fluorescencias. Número máximo de poblaciones que puede separar al mismo tiempo de la misma muestra: seis. Capacidad para separación desde una célula (single cell) en portaobjetos y placas de 6, 12, 48 y 96 pozos (se puede ajustar a otras configuraciones de placa). Instrumento con adaptador para el análisis de nanopartículas.

El citómetro BDInflux tiene la siguiente configuración: 



FACS Aria IIu

Citómetro digital analizador y sorter.

Capacidad de análisis: nueve fluorescencias. Número máximo de poblaciones que puede separar al mismo tiempo de la misma muestra: cuatro.

El citómetro FACS Aria tiene la siguiente configuración:




Aurora
Citómetro espectral analizador.

Capacidad de análisis: hasta 24 fluorescencias (reportadas).


El citómetro Aurora tiene la siguiente configuración:



Para solicitar el servicio por primera vez, favor de referirse a la Información general y condiciones de servicio. Si usted ya es usuario y requiere agendar una cita, puede encontrar las agendas aquí.




20200522

Estación y software de análisis

Este calendario muestra la agenda para el uso de la computadora y el software de análisis disponibles en el laboratorio, no es para el uso de los citómetros. El calendario de los equipos lo encuentras AQUÍ


Este calendario es informativo, con el fin de que los usuarios puedan acceder a la programación de las agendas de los equipos desde donde estén y en cualquier momento. Cabe resaltar que no es posible agendar citas en línea, la solicitud de las mismas se realiza vía telefónica. Una vez que identifique el horario libre que desee apartar, favor de comunicarse por la vía habitual, donde con gusto le atenderemos. 

El calendario se actualiza en tiempo real en horario de oficina (L-V, 8:00-16:00 hrs); si se llegara a agendar una cita pasado este horario, la información será actualizada el día hábil posterior a primera hora. 

Uso del calendario 

Las citas se muestran de un color diferente para la estación de análisis (que cuenta con Infinicyt, FlowJo V, FlowJo 10) el software FlowJo 10

Sobre la esquina superior izquierda del calendario se encuentran, de izquierda a derecha: el botón "Hoy", que lleva la agenda al día en curso; flechas de navegación que permiten desplazarse a la siguiente semana/mes; y un menú desplegable donde se indica la semana/mes mostrados y que se puede abrir para buscar a una fecha específica. Sobre la esquina superior derecha se encuentran las pestañas "Semana", "Mes" y "Agenda" con las que se puede cambiar la visualización del calendario según lo indica su nombre, así como el menú desplegable de los equipos mencionado anteriormente. 

Esperamos que esta información les sea de utilidad. Cualquier duda o comentario no duden ponerse en contacto vía telefónica o por correo electrónico

20180206

Estamos en FluoroFinder

Quien haya tenido que diseñar un panel de anticuerpos fluorocromados desde cero sabe que no es una tarea sencilla. Una vez pasada la etapa de definir adecuadamente la pregunta de investigación y decidir que la citometría de flujo es la herramienta correcta para la búsqueda de respuestas (etapa más importante y en si misma, nada fácil), es cuando empieza el trabajo de elegir los reactivos que vamos a necesitar para identificar y caracterizar adecuadamente a las células de interés para nuestro estudio. Sabemos que este proceso no es sencillo, sin embargo es de vital importancia para obtener resultados confiables y siempre es un plus estar seguros de que todo lo que vamos a comprar nos será útil e idealmente no tendremos que comprar algún anticuerpo extra porque alguno no se pudo leer en el citómetro que tenemos disponible o no fue compatible con el resto del panel, esto es especialmente importante cuando el presupuesto es limitado (lo que desafortunadamente es muy común).

FluoroFinderFluoroFinder es una herramienta en línea que es de gran ayuda para el diseño de paneles multiparamétricos. En esta plataforma podemos encontrar buscadores de reactivos específicos para diferentes aplicaciones (CF, microscopía, WB... etc.) alimentados por una inmensa base de datos, así como información sobre citómetros y programas de análisis, enlaces a múltiples herramientas educativas, paneles validados (OMIPS)... 

Sin embargo, la herramienta más significativa de esta plataforma es el Panel Builder. Esta herramienta nos permite reducir el tiempo que pasamos diseñando paneles de anticuerpos fluorocromados ya que nos ayuda a realizar este proceso en sólo tres pasos que cubren desde el citómetro a utilizar hasta la selección de productos, con la ayuda de su base de datos que incluye más de 150,000 productos de 25 compañías diferentes, esto es: más de 360 opciones de fluorocromos actualizados hasta lo más novedoso en el mercado. Para garantizar que la selección de reactivos va a funcionar en el equipo que vamos a utilizar, FluoroFinder integra la configuración específica de nuestro equipo a su software. También cuenta características avanzadas, como un Spectra Viewer que despliega todos los fluorocromos que hayas seleccionado sin importar quién sea su fabricante, con lo que puedes observar posibles traslapes excesivos de espectros que tal vez puedan ser solucionados cambiando la selección de fluorocromos. El siguiente video presenta una clara introducción a la herramienta Panel Builder de FluoroFinder.





Nuestro Centro de Instrumentos de Citometría cuenta con un enlace personalizado de acceso:


En este se despliegan los equipos que tenemos disponibles con sus configuraciones, para que puedan empezar a construir sus paneles directamente en el citómetro de su interés dependiendo de su pregunta de investigación.

Les recomiendo nuevamente que revisen el video (por si se lo saltaron) y los múltiples recursos que se encuentran en el enlace para que puedan aprovechar al máximo esta útil herramienta. Para una sesión de entrenamiento más profunda o por si tienen dudas, el equipo de FluoroFinder provee cursos dos veces por semana para los cuales pueden registrarse en el siguiente enlace:


De cualquier forma, si tienen más dudas, en el Centro de Instrumentos estamos para ayudarles. Si les gustaría que subiera una explicación más detallada sobre el uso de esta herramienta aquí en nuestra página, no duden en hacérmelo saber.

ProTip. Cuando se registren, háganlo con su nombre y correo electrónico, si tienen uno académico mucho mejor. No es necesario que agreguen una institución (aunque la nuestra ya aparezca en el menú). El uso de la herramienta no tiene ningún costo si es para fines académicos, por lo que les recomiendo usar un correo que tengan de la escuela o si les llegan a preguntar (porque probablemente lo harán mediante el chat), sólo les aclaren que son estudiantes y de qué institución en México. Son muy amables y probablemente les digan que no tienen equipos registrados de su institución y que si quieren pueden agregarlos a la plataforma; si son usuarios de nuestro centro de instrumentos sólo se háganles saber que usan los equipos del IMSS para sus proyectos.